包皮内侧起小水疱可能是过敏、毛囊炎或生殖性疱疹等原因导致，患者需要根据不同病因选择对应的治疗措施。
1、过敏：包皮经常受到摩擦，产生过敏现象，引起局部出现丘疹或丘疱疹，还会伴有瘙痒症状，可以在医生指导下口服盐酸西替利嗪片、氯雷他定片药物治疗。
2、毛囊炎：可能是患者不注意卫生，导致细菌侵入引起，会导致以毛囊为中心出现红色丘疹，可以在医生指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏涂抹治疗。
3、生殖性疱疹：一般是由疱疹病毒感染引起，导致生殖器周围出现透明水疱，并伴有疼痛或瘙痒症状，可以遵医嘱口服伐昔洛韦片或阿昔洛韦片等进行治疗。
除了上述之外，也可能是阴茎珍珠疹，需要到医院检查，然后进行治疗。
